Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms