Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tnnt3Q9QZ47 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnnt3Q9QZ47 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms