Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phtf1Q9QZ09 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phtf1Q9QZ09 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phtf1Q9QZ09 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms