Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abt1Q9QYL7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abt1Q9QYL7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abt1Q9QYL7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abt1Q9QYL7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abt1Q9QYL7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abt1Q9QYL7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abt1Q9QYL7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms