Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndrg3Q9QYF9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndrg3Q9QYF9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndrg3Q9QYF9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ndrg3Q9QYF9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndrg3Q9QYF9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndrg3Q9QYF9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms