Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clic4Q9QYB1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clic4Q9QYB1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms