Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tspan3Q9QY33 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms