Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nr2e3Q9QXZ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e3Q9QXZ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms