Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Homer2Q9QWW1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Homer2Q9QWW1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Homer2Q9QWW1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms