Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chaf1aQ9QWF0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chaf1aQ9QWF0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms