Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms