Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b2Q9JME5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b2Q9JME5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap3b2Q9JME5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap3b2Q9JME5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap3b2Q9JME5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap3b2Q9JME5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap3b2Q9JME5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b2Q9JME5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b2Q9JME5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b2Q9JME5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b2Q9JME5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b2Q9JME5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms