Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LitafQ9JLJ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LitafQ9JLJ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LitafQ9JLJ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms