Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx5Q9JL61 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx5Q9JL61 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms