Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Scamp4Q9JKV5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp4Q9JKV5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms