Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx5Q9JKQ4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms