Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrac1Q9JKP8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrac1Q9JKP8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrac1Q9JKP8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms