Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trem1Q9JKE2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trem1Q9JKE2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms