Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scamp5Q9JKD3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scamp5Q9JKD3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp5Q9JKD3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.5 ms