Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna1fQ9JIS7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna1fQ9JIS7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1fQ9JIS7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms