Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup50Q9JIH2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup50Q9JIH2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup50Q9JIH2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup50Q9JIH2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup50Q9JIH2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup50Q9JIH2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup50Q9JIH2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup50Q9JIH2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup50Q9JIH2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup50Q9JIH2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms