Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copb1Q9JIF7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Copb1Q9JIF7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb1Q9JIF7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms