Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh1a3Q9JHW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh1a3Q9JHW9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms