Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tssc4Q9JHE7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssc4Q9JHE7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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