Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DysfQ9ESD7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DysfQ9ESD7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms