Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube3bQ9ES34 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ube3bQ9ES34 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3bQ9ES34 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms