Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenofQ9ERR7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SelenofQ9ERR7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelenofQ9ERR7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms