Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf23Q9ER63 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf23Q9ER63 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms