Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ80

Nif3l1, NIF3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nif3l1Q9EQ80 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nif3l1Q9EQ80 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nif3l1Q9EQ80 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nif3l1Q9EQ80 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nif3l1Q9EQ80 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Nif3l1Q9EQ80 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nif3l1Q9EQ80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nif3l1Q9EQ80 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nif3l1Q9EQ80 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nif3l1Q9EQ80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nif3l1Q9EQ80 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nif3l1Q9EQ80 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nif3l1Q9EQ80 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 403.6 ms