Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufa8Q9DCJ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms