Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3fQ9DCH4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif3fQ9DCH4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms