Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MNCb-2875Q9DCB3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms