Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Riok3Q9DBU3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Riok3Q9DBU3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.8 ms