Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ftsj3Q9DBE9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ftsj3Q9DBE9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ftsj3Q9DBE9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms