Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtr1Q9DBC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms