Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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Pdzd9Q9D9M4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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Pdzd9Q9D9M4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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Pdzd9Q9D9M4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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Pdzd9Q9D9M4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdzd9Q9D9M4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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Pdzd9Q9D9M4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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