Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ifi35Q9D8C4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ifi35Q9D8C4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms