Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2af1Q9D883 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
U2af1Q9D883 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2af1Q9D883 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms