Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chp2Q9D869 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms