Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4cQ9D7F7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp4cQ9D7F7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4cQ9D7F7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4cQ9D7F7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms