Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnfsf13Q9D777 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf13Q9D777 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13Q9D777 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms