Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D727 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D727 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D727 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D727 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D727 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D727 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D727 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D727 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D727 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D727 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D727 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D727 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D727 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D727 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D727 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D727 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D727 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D727 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D727 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D727 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D727 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D727 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D727 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D727 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D727 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D727 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D727 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D727 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D727 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D727 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D727 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D727 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D727 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D727 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D727 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D727 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D727 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D727 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D727 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D727 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D727 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D727 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D727 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D727 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D727 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D727 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D727 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D727 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D727 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D727 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D727 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D727 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D727 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D727 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D727 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D727 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D727 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D727 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D727 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D727 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D727 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D727 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D727 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D727 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D727 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D727 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D727 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D727 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D727 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D727 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D727 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D727 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D727 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D727 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D727 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D727 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D727 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D727 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D727 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D727 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D727 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D727 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D727 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D727 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D727 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D727 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D727 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D727 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D727 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms