Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MsraQ9D6Y7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MsraQ9D6Y7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms