Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc39Q9D5Y1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc39Q9D5Y1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc39Q9D5Y1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms