Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms