Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rabl3Q9D4V7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabl3Q9D4V7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabl3Q9D4V7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms