Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2al3Q9D4U4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2al3Q9D4U4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al3Q9D4U4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms