Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clvs1Q9D4C9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clvs1Q9D4C9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clvs1Q9D4C9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clvs1Q9D4C9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms