Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trmt44Q9D2Q2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trmt44Q9D2Q2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt44Q9D2Q2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt44Q9D2Q2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms