Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C2

Cby1, Protein chibby homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cby1Q9D1C2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cby1Q9D1C2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cby1Q9D1C2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cby1Q9D1C2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms